手术室排风系统和辅助用房排风系统应分开设置。各手术室的排风管可单独设置，也可并联，并应和新风系统联锁。
排风管出口不得设在楼板上的设备层内，应直接通向室外。
每间正压手术室的排风量不宜低于250m³／h，需要排除气味的手术室（如剖腹产手术室）排风量不应低于送风量的50%。其他负压房间排风量由设计确定。
手术室内污染源有麻醉余气、聚集在术者周围的医护人员的人的气味，术者开刀时腔体内发出臭气，加上顺势接管手术刀发生的有毒气溶胶等，手术室内应采用局部排风，而不采用普通空调系统回风管路上设排风。当手术部设置设备层时，排风机宜设置于设备层内，以便于安装维护。
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